Что делать с третьим набором проводов в этой распределительной коробке?

Вам нужен только один комплект, плюс ножки переключателя, так что у вас действительно есть два дополнительных комплекта. Невозможно сказать наверняка, не зная, куда и для чего они идут, но, скорее всего, цепь просто разветвляется, чтобы питать разные ветви одной и той же цепи.

Вы можете безопасно соединить все нейтральные провода и все заземляющие провода. С фазными проводами дело обстоит не так однозначно, но, скорее всего, их тоже можно соединить вместе. Единственное, что не соединено с аналогичными проводами, — это обратный провод от выключателя, который идёт напрямую к светильнику. Другой провод светильника идёт ко всем нейтральным проводам.

Чтобы определить, куда идут дополнительные провода (один из них, очевидно, идёт к выключателю, но есть и другие), надёжно изолируйте все провода, чтобы они не касались друг друга или чего-либо ещё. Снова включите питание. Там, где что-то не работает, и находятся провода. Из тех мест, где что-то не работает, провода, скорее всего, идут напрямую к ближайшим к светильнику и выключателю коробкам, но без проверки целостности цепи в других коробках и за их пределами нельзя быть уверенным.