Нужна ли защита от перенапряжения для устройства с двухконтактной вилкой?

Заземление двухконтактных адаптеров здесь ни при чём. Назначение сетевого фильтра

для защиты электрических устройств от скачков напряжения. Устройство защиты от перенапряжения
пытается ограничить напряжение, подаваемое на электрическое устройство, либо
блокируя, либо замыкая на землю любые нежелательные напряжения, превышающие безопасный
порог

http://en.wikipedia.org/wiki/Защита_от_импульсных_напряжений

Другими словами, идея сетевого фильтра заключается в том, чтобы предотвратить попадание скачков напряжения на ваше устройство. Пока сам сетевой фильтр заземлён, отсутствие заземления у ваших устройств не имеет значения.

Используемые вами зарядные устройства/адаптеры представляют собой небольшие трансформаторы. Они преобразуют переменный ток напряжением 120 В в постоянный ток определённой силы с помощью магнитных полей (провода, намотанного определённое количество раз на одну сторону магнита для входящего тока, и провода, намотанного другое количество раз на другую сторону магнита для исходящего тока). Скачок напряжения (например, 1000 В вместо обычных 120 В) в этом устройстве, в свою очередь, приведёт к тому, что магнит будет преобразовывать гораздо больше энергии. Таким образом, если на выходе должно быть 9 В, то на выходе может быть целых 900 В.

Так что да, безусловно, используйте сетевой фильтр, независимо от количества контактов в вашем устройстве.